هدف اصلی از راه اندازیِ این بخش، تدوین محتواهای مهارتی – تربیتی با مستندات علمی بر پایه‌ی روش تربیتی اهل بیت ^{علیهم السلام}، جهت ارائه به مراکز علمی، دینی و تربیتی سراسر کشور و جهان است. لازم به ذکر است آنچه شیوه‌‌ی تربیتیِ رسول خاتم و 12 هدایتگر پس از ایشان را از روش‌‌‌های تربیتیِ دیگر متمایز‌‌‌ می‌کند آن است که ایشان مبنای تربیت را عقلانیت و تذکرات فطری - وجدانی قرار داده اند. لذا پایگاه علمی فرهنگی محمد (ص) تلاش نموده معنای صحیح «عقل»، «فطرت»، «معرفت»، «علم»، ... در دیدگاه اهل بیت ^{علیهم السلام} را بیان کند و ابزارهایی را که آدمی برای تربیت صحیح و خوشبختی حقیقی نیازمند است معرفی نماید. نتیجه‌‌ی مطالعات و پژوهش‌‌‌های اعضای پایگاه علمی، فرهنگی محمد (ص)، به صورت مقالات، درسنامه ها، کارگاه ها، کتب و جزوات به مخاطبان عرضه‌‌‌ می‌گردد.

علاقمندان‌‌‌ می‌توانند برخی از تولیداتِ این بخش را تحت عناوین «آثار و مقالات»، «درسنامه ها»، «شبهات روز»، «مناسبت ها» و «ستارگان هدایت» در پایگاه علمی، فرهنگیِ بنیاد محمد (ص) مطالعه فرمایند.