جهت خدمت رسانی بیشتر و با کیفیت مطلوب‌تر، فعالیت‌‌‌های بنیاد علمی، فرهنگی محمد (ص)، در بخش‌‌‌های تخصصیِ زیر صورت‌‌‌ می‌گیرد:

-     کودک و نوجوان

-     علمی و فرهنگی

-     ادیان و فرق

-     خیریه

-     مشاوره

-     دوره های آموزشی